centos6.5安裝R語(yǔ)言出現問(wèn)題怎么解決

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環(huán)境：虛擬機centos6.5 內核為2.6.32-696.1.1.el6.x86_64(這是更新后的內核版本，沒(méi)更新之前比這個(gè)版本低)、R-3.3.2

在網(wǎng)上大多攻略都是先下載R壓縮包，然后解壓，配置安裝，步驟如下：

(1)下載安裝包

wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.2.2.tar.gz

(2)解決依賴(lài)包

#yum install gcc-gfortran

#yum install gcc gcc-c++

#yum install readline-devel

#yum install libXt-devel

(3)解壓安裝

# tar xvf R-3.3.2.tar.gz

# cd R-3.3.2

# ./configure

# make

# make install

在進(jìn)行make時(shí)，報錯make: *** No targets specified and no makefile found. Stop.

這就尷尬了，知道問(wèn)題來(lái)了，找度娘，找到一篇博文，說(shuō)兩個(gè)原因，一個(gè)是內核太舊，一個(gè)是依賴(lài)包沒(méi)裝全，就先更新個(gè)內核

yum update

更新到一半斷掉了，那么問(wèn)題又來(lái)了，重新啟動(dòng)時(shí)報錯vfs:unable to mount root fs on unknown-block(0,0)

又找度娘，發(fā)現是升級時(shí)沒(méi)更新完全，grub引導文件有問(wèn)題，就到/boot/grub/menu.lst查看，發(fā)現最新版本啟動(dòng)命令中缺少initrd，可是天生愚鈍，搞不清這個(gè)東西是怎么生成的，搞了好久也沒(méi)搞好，無(wú)奈，只能卸掉內核重新更新；

yum remove kernel 2.6.32-696.1.1.el6.x86_64

卸載完后，重新yum update，完美升級！刪除掉舊內核，升級算是解決了。

然后再解壓安裝，還是報錯，那就是依賴(lài)包沒(méi)裝完全，在執行./configure過(guò)程中其實(shí)就是在檢查依賴(lài)包，第一次安裝時(shí)沒(méi)太注意，后來(lái)發(fā)現這樣一段

checking for zlib.h... yes

checking if zlib version >= 1.2.5... no

checking whether zlib support suffices... configure: error: zlib library and hea     ders are required

再查看內核的zlib

rpm -qa | gerp zlib

發(fā)現內核自帶zlib是1.2.3版本的，可見(jiàn)版本太低造成的，問(wèn)題確定了，接著(zhù)度娘，找到一篇博客https://www.hitoy.org/use-the-compiled-zlib-library-to-replace-the-system-integration-one.html

說(shuō)是要先升級zlib，我想這先卸載，再升級，可是系統不讓卸載，后來(lái)才發(fā)現zlib是內核中很重要的部分，依賴(lài)非常多，所以不能卸載；那就直接升級吧，yum install zlib，卻告訴我系統已經(jīng)安裝，無(wú)奈自己在網(wǎng)上下載個(gè)，按照上面博客的說(shuō)法做下去，最后安裝時(shí)依舊是找不到zlib！

這個(gè)問(wèn)題糾結了我兩天，沒(méi)辦法換zlib版本，在網(wǎng)上重新下載了個(gè)zlib-1.2.5版的

./configure

make

make install

上述問(wèn)題看樣子是現有內核版本不支持最新版zlib，所以還是用個(gè)低版本的??！

再安裝R又報錯bzip2版本太低，要求要大于等于bzip2-1.0.6，內核自帶版本是bzip2-1.0.5，網(wǎng)上下載，安裝，接著(zhù)報錯

/usr/bin/ld: blocksort.o: relocation R_X86_64_32 against `.rodata.str1.1' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC

blocksort.o: could not read symbols: Bad value

collect2: ld returned 1 exit status

make: *** [all] Error 1

無(wú)奈，接著(zhù)找度娘，需要修改Makefile-libbz2_so中的CC=gcc 為CC=gcc -fPIC，并且解壓文件中沒(méi)有configure，需要先執行 make -f Makefile-libbz2_so，然后在make install；

再次安裝R，問(wèn)題依舊，這就尷尬了，各種百度，都沒(méi)有解決，問(wèn)題只能是定位到系統內核本身了，就像第一次安裝zlib-1.2.11版本系統不識別一樣，看來(lái)是系統不兼容bzip2-1.0.6版本，所以這種自己動(dòng)手安裝的辦法不可行了，拋棄！

最后百度了一個(gè)只需要三個(gè)步驟的方法，大體是說(shuō)，先更新系統內核，利用第三方yum源epel，其中包含了最新的各種軟件包，之后就像安裝軟件一樣利用yum安裝R，是成功的，步驟如下：

su -c "rpm -Uvh http://download.fedoraproject.org/pub/epel/6/i386/epel-release-6-8.noarch.rpm"

yum update

yum install R

附圖如下：

下載yum源

更新yum源

安裝R過(guò)程